|
Tópicos
Introdução
Fases de Ligação
Duplo heterozigoto - Genes
independentes
Duplo heterozigoto - Genes em
aproximação
Duplo heterozigoto - Genesem
repulsão
Distância, % Recombinação, %Quiasma
Ligação - Cruzamento Teste
Ligação - Progênie F2
INTRODUÇÃO
Ligação fatorial diz respeito a existência de 2 ou
mais genes, localizados no mesmo cromossomo. O fenômeno
foi descoberto em 1906 por BATESON e PUNNETT, que
verificaram a falta de independência de dois genes em
ervilhas. Quando os genes estão muito próximos, no
mesmo cromossomo, dizemos que ocorre "linkage
completa" e quando eles estão suficientemente
separados dizemos que ocorre "linkage parcial".
FASES DE LIGAÇÃO
Para se ter um entendimento sobre ligação fatorial é
necessário que inicialmente seja apresentado o conceito
e tipos de fases de ligação. Existem dois tipos de
fases de ligação, as quais serão descritas a seguir:
Fase
de aproximação ou acoplamento
É a condição na qual os dois alelos dominantes (ou
recessivos) tem maior probabilidade de penetrar
simultaneamente em um gameta. Ou é a fase em que estão
em um mesmo cromossomo os alelos dominantes (ou
recessivos) dos dois genes.
A B// a b
Fase
de repulsão
É a condição na qual o alelo dominante de um gene e o
alelo recessivo de outro gene tem maior probabilidade de
penetrar simultaneamente em um gameta. Ou, é a fase em
que estão num mesmo cromossomo o alelo dominante de um
gene e o alelo recessivo do outro gene.
A b// a B
DUPLO HETEROZIGOTO - GENES
INDEPENDENTES
O duplo-heterozigoto com genes independentes é
representado simbolicamente por AaBb e apresenta as
seguintes características:
- Probabilidade de gametas carregarem alelos :P(A) = P(a)
= P(B) = P(b) = ½
- Gametas produzidos : ¼ A B : ¼ Ab : ¼ aB : ¼ ab
- Relação fenotípica na descendência do cruzamento
entre duplo-heterozigotos : RF: 9:3:3:1
DUPLO
HETEROZIGOTO - GENES EM PROXIMAÇÃO
O duplo-heterozigoto com genes em fase de aproximação
é representado por AB//ab. São observadas as seguintes
características:
- Probabilidade de gametas carregarem alelos :P(A) = P(a)
= P(B) = P(b) = ½
- Gametas produzidos: A B e ab, com freqüência P, e Ab
e aB, com freqüência R. Em que P e R referem-se,
respectivamente, aos tipos paternais e recombinantes.
Pode-se verificar que P é maior ou igual a R. O valor de
P será igual ao de R, quando os genes estiverem ligados,
mas ocorrer freqüência de recombinação igual a 50%,
de tal forma que a segregação se verificará da mesma
forma se estes genes fossem independentes.
- Relação fenotípica na descedência do duplo-heterozigoto:
Neste caso a proporção 9:3:3:1 é alterada. A proporção
de indivíduos homozigotos recessivos torna-se, de
maneira geral, superior a 1/16.
Observa-se que, se os genes estão ligados, a segregação
de um par de não-alelos não ocorre de maneira
independente. Se um gameta é portador de um alelo A a
probabilidade dele também ser portador do alelo B é
maior do que a do alelo b, pois neste caso haveria
necessidade de recombinação gênica, que é um evento
raro.
DUPLO
HETEROZIGOTO - GENES EM REPULSÃO
O duplo-heterozizoto em fase de repulsão é representado
por Ab//aB. São observadas as seguintes propriedades:
- Probabilidade de gametas carregarem alelos :P(A) = P(a)
= P(B) = P(b) = ½
Gametas produzidos: A b e a B, com freqüência P, e A B
e a b, com freqüência R.
- Relação fenotípica na descendência do duplo-heterozigoto
também é diferente da 9:3:3:1. A proporção de
homozigotos recessivos é inferior a 1/16.
DISTÂNCIA,
%RECOMBINAÇÃO, % QUIASMA
Durante a meiose o cromossomo se divide longitudinalmente
dando origem a duas cromátides irmãs. Os cromossomos
homólogos se pareiam dando origem a uma estrutura
denominada de tétrades ou bivalentes. Quando não existe
permuta (ou quiasmas) todos os gametas serão do tipo
paternal e quando existe permuta serão formados ½ dos
gametas do tipo paternal e a outra metade do tipo
recombinante. Considerando 4 tétrades (T) em 4
diferentes células e que cada célula dará origem a 4
gametas, pode-se predizer os tipos de gametas formados
conforme ilustrado a seguir. O símbolo "x"
representa a presença de quiasma na tétrade e
"-" representar a ausência do mesmo.
| Tétrades
Gametas |
| T1
|
T2
|
T3
|
T4
|
gameta
P |
gameta
R |
Quiasmas(%) |
Recombinação(%) |
| x
|
x
|
x
|
x
|
8
|
8
|
100
|
50 |
| x
|
x
|
x
|
-
|
10
|
6
|
75
|
37.5 |
| x
|
x
|
- |
-
|
12
|
4
|
50
|
25 |
| x
|
- |
-
|
-
|
14
|
2
|
25
|
12.5 |
| -
|
- |
-
|
-
|
16
|
0
|
0
|
0 |
Analisando a tabela acima conclui-se que:
(1/2) % QUIASMA = % RECOMBINAÇÃO
A porcentagem de recombinação é também função da
distância entre os genes. Quanto maior for a distância
entre dois genes, maior será a probabilidade de ocorrer
um quiasma naquela região e, consequentemente, maior será
a porcentagem de recombinação.
A curva de relação entre porcentagem de recombinação
e a distância entre genes foi estabelecida para vários
organismos. Assim, para pequenas distâncias entre os
genes, inferior a 20 centimorgans (ou "unidade de
distância" ou "unidades mapa"), tem sido
adotada a seguinte expressão:
% Recombinação = Distância entre os genes
LIGAÇÃO
- CRUZAMENTO TESTE
Ligações fatoriais podem ser avaliadas analisando a
progênie do cruzamento entre um duplo-heterozigoto e
outro em homozigose recessiva (cruzamento teste).
Será dado um exemplo em que se considera dois genes. O
gene A/a controla o formato do fruto (A/a fruto redondo/alongado)
e o gene B/b a inflorescência (B/b inflorescência
simples/composta). A descendência do cruzamento teste é
apresentada, permitindo as seguintes análises.
| Fenótipo
|
Observado |
| Redondo,
Simples |
83 |
| Redondo,
Composta |
19 |
| Alongado,
Simples |
23 |
| Alongado,
Composta |
85 |
Constatação da evidência de
ligação fatorial
Considera-se inicialmente a hipótese de que os genes são
independentes. Avalia-se a segregação de cada loco
individualmente, verificando a proporção 1:1, e,
posteriormente, a segregação conjunta de 1:1:1:1.
Considera-se que um duplo-heterozigoto (AaBb) quando
submetido ao cruzamento teste dá como resultado os
valores:
"A B" = a1
"A b" = a2
"a B" = a3
"a b" = a4
Ao lançar a hipótese de independência de segregação
entre os genes A/a e B/b, deve-se esperar uma razão de
segregação igual a 1:1:1:1. Esta proporção poderá
ser testada pelo qui-quadrado, considerando todas as 4
classes fenotípicas e fazendo o teste com 3 graus de
liberdade. Entretanto, a rejeição desta hipótese não
implica que os genes estejam ligados, pois é possível
que o gene A/a e/ou B/b não está segregando na proporção
esperada de 1:1. Para se estudar esta possibilidade
devere-se decompor os 3 graus de liberdade do qui-quadrado,
obtido da análise das 4 classes fenotípicas em:
Qui-quadrado A/a (QQ)
Mede a segregação do loco A/a na hipótese de segregação
1:1. Está associado a 1 grau de liberdade. Pode ser
calculado considerando:
| Fenótipo
|
Observado |
Esperado
|
Desvio |
| "A"
|
a1
+ a2 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
d |
| "a"
|
a3
+ a4 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
-d |
de onde se obtém:
QQ = 2d²/ESP = 4d²/N = (a1 + a2 - a3 - a4)²/N
N = a1 + a2 + a3 + a4
Qui-quadrado B/b (QQ)
Mede a segregação do loco B/b na hipótese de segregação
1:1. Está associado a 1 grau de liberdade. Pode ser
calculado considerando:
| Fenótipo
|
Observado |
Esperado
|
Desvio |
| "B"
|
a1
+ a3 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
d |
| "b"
|
a2
+ a4 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
-d |
de onde se obtém:
QQ = 2d²/ESP = 4d²/N = (a1 - a2 + a3 - a4)²/N
Qui-quadrado L (QQ)
Mede a segregação conjunta de A/a e B/b baseada no
princípio de ortogonalidade. Está associado a 1 grau de
liberdade. Existindo ligação fatorial, as classes
"AB + ab" e "aB + Ab" corresponderão
às classes paternais e recombinantes, respectivamente,
nos casos do duplo-heterozigoto estar em fase de aproximação,
ou, ao contrário, nos casos em que o duplo-heterozigoto
se encontrar em repulsão.
Em qualquer um dos casos (aproximação ou repulsão) a
igualdade de "AB + ab" = "aB + Ab",
testa a hipótese de que P = R = 0,5, em que não existe
ligação fatorial, sendo P a classe paternal e R a
classe recombinante. Assim, considera-se os seguintes
valores:
| Fenótipo
|
Observado |
Esperado
|
Desvio |
| "AB
+ ab" |
a1
+ a4 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
d |
| "aB
+ Ab" |
a2
+ a3 |
(a1
+ a2 + a3 + a4)/2 |
-d |
de onde se obtém:
QQ = (a1 - a2 - a3 + a4)²/N
Genótipo do F1
O genótipo do F1 é estabelecido a partir de seus
gametas do tipo paternal. O cruzamento teste é de grande
utilidade, pois as freqüências dos indivíduos refletem
a freqüência dos gametas produzidos pelo F1. Aqueles de
maior freqüência são os paternais (P) e os de menores
freqüências são os recombinantes (R). Neste caso, tem-se:
| Fenótipo
|
Gameta
vindo do F1 |
Freqüência |
Tipo
de gameta |
| Redondo,
Simples |
A
B |
23
|
R |
\n';
document.write(barra);
}
}
changePage();
| Redondo,
Composta |
A
b |
85
|
P |
| Alongado,
Simples |
a
B |
83
|
P |
| Alongado,
Composta |
a
b |
19
|
R |
Como as classes paternais, de maior freqüência, se
referem aos gametas Ab e aB, conclui-se que o duplo-heterozigoto
envolvido no cruzamento teste apresenta os genes ligados
em repulsão, de tal forma que seu genótipo é
representado por Ab//aB.
Distância entre os genes
A distância entre os genes é estimada por meio da freqüência
dos gametas recombinantes, identificados por R. Assim, no
exemplo, tem-se:
d = [100(R+R))]/TOTAL = [100(19+23)]/210 = 20% = 20
centimorgans
LIGAÇÃO
- PROGÊNIE F2
A utilização de cruzamentos teste em estudos de ligação
fatorial tem sido adequada pela possibilidade de
identificação do genótipo e gametas do progenitor
através de sua descendência. Entretanto, muitas vezes
devemos avaliar a existência de ligação fatorial em
dados resultantes de uma geração F2.
Será novamente considerado o exemplo em que se considera
dois genes. O genes A/a controla o formato do fruto (A/a
fruto redondo/alongado) e o genes B/b a inflorescência (B/b
inflorescência simples/composta). A descendência F2 é
apresentada, permitindo as seguintes análises.
| Fenótipo
|
Observado |
| Redondo,
Simples |
102 |
| Redondo,
Composta |
48 |
| Alongado,
Simples |
48 |
| Alongado,
Composta |
2 |
Avaliação da existência de
ligação fatorial
Ao lançar a hipótese de independência de segregação
entre os genes A/a e B/b, deve-se esperar uma razão de
segregação igual a 9:3:3:1. Esta proporção poderá
ser testada pelo qui-quadrado, considerando todas as 4
classes fenotípicas e fazendo o teste com 3 graus de
liberdade. Entretanto, a rejeição desta hipótese não
implica que os genes estejam ligados, pois é possível
que o gene A/a e/ou B/b não está segregando na proporção
esperada de 3:1. Para se estudar esta possibilidade deve-se
decompor os 3 graus de liberdade do qui-quadrado, obtido
da análise das 4 classes fenotípicas.
Considera-se que um duplo-heterozigoto, quando
autofecundado, proporciona a seguinte descendência:
"A B" = a1
"A b" = a2
"a B" = a3
"a b" = a4
As seguintes expressões de qui-quadrado podem ser
obtidas a partir deste conjunto de dados:
Qui-quadrado Total
Testa a hipótese de segregação 9:3:3:1. Em casos de
significância, não se pode concluir que os genes
estejam ligados, pois é possível que haja problemas na
segregação de cada loco individualmente.
Qui-quadrado A/a (QQ)
Testa a segregação 3:1 do loco A/a. Pode ser obtido
através da expressão:
QQ = (a1 + a2 -3a3 - 3a4)²/3N, está associado a 1GL.
Qui-quadrado B/b (QQ)
Testa a segregação do loco B/b na proporção de 3:1.
Este qui-quadrado está associado a 1 grau de liberdade e
é obtido pela expressão:
QQ = (a1 - 3a2 + a3 - 3a4)²/3N, está associado a 1GL
Qui-quadrado L
Testa a segregação conjunta dos genes A/a e B/b. É
obtido pelo princípio de ortogonalidade e está
associado a 1 grau de liberdade.
QQ = (a1 - 3a2 - 3a3 + 9a4)²/9N
Identificação do genótipo do F1
A existência de ligação fatorial pode ser constatada
pela freqüência do homozigoto recessivo que será
superior a 1/16 quando os genes estiverem ligados em fase
de aproximação e inferior a 1/16 quando os genes
estiverem ligados em fase de repulsão. Para o exemplo em
consideração, verifica-se que:
f(homozigoto recessivo) = f(enrolada, anãs) = 2/200=0,01
Como este valor é inferior a 1/16 (= 0,0625) conclui-se
que trata-se de um F1, duplo-hetrozigoto com genes em
repulsão, ou seja: Ab//aB
Cálculo da distância entre os
genes
A distância entre os genes poderá ser calculada através
das proporções esperadas, mostradas na tabela a seguir:
| Fenótipos |
Fase
de Aproximação |
Fase
de Repulsão |
| A_B_
|
0.75
- [d(2-d)/4] |
0,5
+ d²/4 |
| A_bb
|
d(2-d)/4 |
0,25
- d²/4 |
| aaB_
|
d(2-d)/4
|
0,25
- d²/4 |
| aabb
|
0.25
- [d(2-d)/4] |
d²/4 |
Assim, pode-se determinar a distância entre os genes
através das expressões:
a- Fase de aproximação
d = 1 - 2Raiz[ f(aabb)]
b- Fase de repulsão
d = 2Raiz[ f(aabb)]
Para o exemplo em consideração, tem-se:
d = 2Raiz[ f(aabb)] = 2Raiz(2/200) = 20% = 20
centimorgans

|